Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phtf1Q9QZ09 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms