Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms