Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms