Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnpy2Q9QXT0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms