Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim44Q9QXA7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim44Q9QXA7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms