Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Dkk3Q9QUN9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dkk3Q9QUN9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms