Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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