Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl2Q9QUK0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms