Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms