Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nova1Q9JKN6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nova1Q9JKN6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms