Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms