Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms