Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ddx20Q9JJY4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddx20Q9JJY4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Ddx20Q9JJY4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Ddx20Q9JJY4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Ddx20Q9JJY4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Ddx20Q9JJY4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Ddx20Q9JJY4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Ddx20Q9JJY4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms