Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc6l2Q9JIM3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc6l2Q9JIM3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms