Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod3Q9JHJ0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmod3Q9JHJ0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmod3Q9JHJ0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmod3Q9JHJ0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod3Q9JHJ0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms