Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PalldQ9ET54 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PalldQ9ET54 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms