Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hipk3Q9ERH7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms