Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfcp2Q9ERA0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tfcp2Q9ERA0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms