Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER62

Tnfrsf22, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 22, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf22Q9ER62 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf22Q9ER62 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf22Q9ER62 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf22Q9ER62 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf22Q9ER62 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf22Q9ER62 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf22Q9ER62 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf22Q9ER62 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf22Q9ER62 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf22Q9ER62 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms