Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rhox9Q9EQM5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhox9Q9EQM5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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