Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms