Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf1Q9EPU4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms