Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r54Q9EPB8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r54Q9EPB8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms