Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pop7Q9DCH2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms