Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms