Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smco2Q9DA21 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco2Q9DA21 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms