Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl17Q9D8P4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl17Q9D8P4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms