Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl4Q9D8E6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl4Q9D8E6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms