Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn22Q9D7U6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms