Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N3

Mrps9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps9Q9D7N3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrps9Q9D7N3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrps9Q9D7N3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms