Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms