Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Echdc3Q9D7J9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms