Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Capns2Q9D7J7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Capns2Q9D7J7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms