Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7G0

Prps1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps1Q9D7G0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prps1Q9D7G0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prps1Q9D7G0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prps1Q9D7G0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prps1Q9D7G0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prps1Q9D7G0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prps1Q9D7G0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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