Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Q9D7E4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D7E4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms