Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Nop56Q9D6Z1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Nop56Q9D6Z1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Nop56Q9D6Z1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nop56Q9D6Z1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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