Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sec23bQ9D662 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sec23bQ9D662 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sec23bQ9D662 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sec23bQ9D662 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sec23bQ9D662 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sec23bQ9D662 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sec23bQ9D662 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sec23bQ9D662 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sec23bQ9D662 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sec23bQ9D662 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sec23bQ9D662 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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