Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4f1Q9D5Q6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Speer4f1Q9D5Q6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Speer4f1Q9D5Q6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4f1Q9D5Q6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4f1Q9D5Q6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4f1Q9D5Q6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4f1Q9D5Q6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4f1Q9D5Q6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4f1Q9D5Q6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4f1Q9D5Q6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4f1Q9D5Q6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4f1Q9D5Q6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms