Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc130Q9D516 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc130Q9D516 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms