Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D454 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D454 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D454 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D454 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D454 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D454 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D454 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D454 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D454 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D454 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D454 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D454 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D454 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D454 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D454 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D454 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D454 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D454 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D454 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D454 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D454 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D454 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D454 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D454 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D454 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D454 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D454 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms