Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms