Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms