Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Chchd2Q9D1L0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Chchd2Q9D1L0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Chchd2Q9D1L0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms