Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms