Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms