Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syf2Q9D198 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms