Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc167Q9D162 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms