Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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Hddc3Q9D114 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc3Q9D114 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc3Q9D114 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc3Q9D114 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc3Q9D114 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc3Q9D114 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Hddc3Q9D114 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc3Q9D114 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hddc3Q9D114 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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Hddc3Q9D114 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Hddc3Q9D114 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Hddc3Q9D114 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Hddc3Q9D114 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Hddc3Q9D114 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Hddc3Q9D114 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hddc3Q9D114 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hddc3Q9D114 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hddc3Q9D114 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc3Q9D114 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hddc3Q9D114 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms