Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srfbp1Q9CZ91 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms