Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Prdm5Q9CXE0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Prdm5Q9CXE0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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